Pemerintah Provinsi Papua berkewajiban:

1. menjamin kebebasan, membina kerukunan, dan melindungi semua umat beragama untuk menjalankan ibadah sesuai dengan agama dan kepercayaan yang dianutnya;

2. menghormati nilai-nilai agama yang dianut oleh umat beragama;

3. mengakui otonomi lembaga keagamaan; dan

4. memberikan dukungan kepada setiap lembaga keagamaan secara proporsional berdasarkan jumlah umat dan tidak bersifat mengikat.